皖南医学院第二附属医院眼科是一家正规的近视矫正、眼整形机构，皖南医学院第二附属医院眼科正处于转型发展期，集临床、教学、科研为一体，设有床位9张。科室拥有裂隙灯、眼底镜、非接触眼压计、角膜地形图仪、超声角膜测厚仪、睫状体冷冻仪、手术显微镜、电脑验光仪、综合验光仪、同视机等;另有眼科AB超，眼科电生理检查仪。

　　科室开展白内障小切口摘除联合人工晶体植入术、青光眼小梁切除术、青光眼睫状体冷冻术、眼睑成形术、翼状胬肉显微切除联合自体移植手术、眼眶肿瘤摘除术、复杂视网膜脱离手术等二、三类手术。

　　门诊开展眼屈光检查等，眼超声诊断在超声科完成，眼电生理检查在肌电图室进行。

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